Na sua constituição... a matéria é composta de moléculas, que por sua vez são compostas de átomos, que por sua vez são compostos de partículas (no núcleo protões e neutrões; em redor uma nuvem de eletrões). A energia tem varias formas (e.g.: térmica, mecânica, cinética, elétrica, magnética, gravítica) e só se deteta pelos EFEITOS que causa na matéria. Por exemplo, quando ligamos o fogão estamos a transformar energia elétrica em térmica e é esta que vai aquecer os alimentos. E a energia elétrica de onde veio? Da tomada, que coloca dois terminais a um potencial elétrico diferente. E podíamos ir, por aí fora, encontrando vários tipos de energia que se vão transformando. "No Universo nada se cria, nada se destrói, tudo se transforma" é um dos princípios básicos da Física. Ver, por exemplo, (inglês): https://en.wikipedia.org/wiki/Energy