Excelente pergunta Joana, mas o nosso conhecimento ainda tem algumas lacunas:
1ª lacuna: como a biologia se separou da química. Oparin (biólogo soviético) e Haldane (biólogo britânico) apresentaram na teoria da vida que esta nasceu numa sopa primordial. Esta "sopa" continha os átomos essenciais à vida (hidrogénio, oxigénio, carbono, azoto, fósforo, enxofre...). Devido às acções de calor e descargas eléctricas (tempestades) estes elementos podem ter-se juntado e formado aminoácidos. Miller e Urey demonstraram que isto era possível. Mas aqui entra a primeira lacuna. Sabemos como a matéria inorgânica se transformou em matéria orgânica mas não sabemos como a matéria orgânica se transformou numa molécula simples capaz de se auto-reproduzir (esta molécula provavelmente seria uma versão muito simples de ADN). Quanto à segunda parte da questão, Charles Darwin com a sua teoria da evolução justifica a diversidade. A nível genético (DNA) ocorrem mutações que podem alterar a estrutura física do ser vivo. Pegamos no exemplo da girafa. Tens uma girafa A e a girafa B. O pescoço da girafa A é maior do que o da girafa B. Assim a Girafa A consegue ter acesso a mais alimento que se encontra nas árvores do que a girafa B. Portanto a girafa A adapta-se melhor que a B e assim a A tem mais hipóteses de sobreviver, o que faz com que a B possa extinguir-se. A isto chamamos selecção natural. Ou seja se a mutação que ocorrer (neste caso o tamanho do pescoço aumentou) aumentar a hipótese de sobrevivência da espécie esta mutação acaba por predominar porque a espécies que têm esta característica passam para os seus descendentes. Agora imagina as mesmas girafas mas num outro sítio do planeta em que as árvores são todas baixinhas. Agora esta mutação não dá vantagem nenhuma à girafa para sobreviver, portanto neste local é provável que as girafas tenham pescoço mais pequeno. Através da selecção natural conseguimos ter uma grande variedade de espécies.
Uma outra lacuna é a consciência. Ninguém sabe explicar a sua formação nem porque a temos. Quando descobrirmos poderemos colocar uma consciência em robots?

(Contributo de um cidadão.)